‍‍‍‍西南大学昆虫分子生态学研究起步于1986年由农业部批准建立的应用昆虫及螨类研究室，1996年建设成为农业部昆虫学及害虫控制工程重点实验室，2005年遴选为重庆市市级重点实验室。研究团队2009年入选教育部创新团队发展计划，2018年入选教育部和国家外专局“111”计划学科创新引智基地。

昆虫分子生态学创新团队由国家“万人计划”领军人才和特聘专家共同领衔。团队现有专职教学科研人员9名，其中教授4名、副教授5名，博士后、博士生和硕士生50余名。团队成员均具有博士学位和国外学习经历，与美国、比利时、澳大利亚、法国的多个研究机构有密切的科研合作，在国内外有较大的学术影响。

研究团‍‍队以作物实蝇、叶螨、蚜虫‍‍等重大农业害虫为主攻对象，聚焦其生长发育与繁殖策略、抗逆分子生态机制、化学通讯神经生理以及与病毒互作机制等研究方向，以期在理论上揭示昆虫与外界因子互作、生长发育及通讯的分子调控机制，在实践上为害虫生态调控及环境友好型新靶点的研发提供技术支撑。

研究团队揭示了桔小实蝇抗逆及生殖行为的分子调控机制，首次报道动物线粒体基因组的对称与非对称双裂化现象，发掘多个具有药靶潜力的神经肽受体。为我国首个柑桔非疫区顺利建成、保障柑桔产业持续健康发展做出重要贡献。在ARE、PNAS、IBMB等高水平刊物发表论文150余篇，授权发明专利10项，获省部级科技奖励10项。‍‍‍‍